Petit cours d’épidémiologie mathématique

Ceci est la version web étendue d’un Petit cours d’épidémiologie mathématique, que j’ai donné à N’Djaména fin juin 2022. D’ici, vous avez accès à la version html des cours ainsi qu’aux vidéos du cours.

Pour voir les fichiers dans un autre format, pour accéder au code, etc., cliquez sur le bouton View on GitHub pour avoir accès au dépôt. Vous pouvez également charger tout le dépôt en cliquant sur les boutons à gauche. (Vous pouvez aussi cloner le dépôt, mais il faudra faire cela depuis la version GitHub.)

Quelques remarques au sujet de la liste des cours ci-dessous:

• Je suis en train d’enregistrer les vidéos, celles qui sont disponibles sont indiquées par la présence d’un lien. On peut aussi les trouver directement dans cette liste YouTube.
• Tous les transparents ci-dessous sont susceptibles de changer (pour corriger des coquilles, améliorer le flux, ajouter du contenu, etc.).
• En particulier, il est fréquent que les transparents diffèrent un peu de la version utilisée lors de l’enregistrement de la vidéo. Si la variation devient trop grande, je ré-enregisterai la vidéo.

Liste des cours

• Cours 00: Organisation du cours (vidéo)
• Cours 01: Épidémies, épidémiologie et épidémiologie mathématique (vidéo)
• Cours 02: Introduction à R et résolution numérique des EDO (vidéo)
• Cours 03: Collecte et utilisation des données (vidéo)
• Cours 04: Le modèle SIS (vidéo)
• Cours 05: Fonctions d’incidence (vidéo)
• Cours 06: Le modèle de Kermack et McKendrick (vidéo)
• Cours 07: Étapes de l’analyse mathématique des modèles, $R_0$ et la taille finale d’une épidémie (vidéo)
• Cours 08: Le modèle SLIRS/SEIRS (vidéo)
• Cours 09: Temps de résidence dans les compartiments (vidéo)
• Cours 10: Quelques modèles épidémiques (vidéo)
• Cours 11: Plus de modélisation (vidéo)
• Cours 12: Propagation dans des groupes et propagation spatio-temporelle des épidémies (vidéo)
• Cours 13: Modèles de groupes (vidéo)
• Cours 14: Modèles dans des métapopulations (vidéo)
• Cours 15: Un peu de stabilité globale
• Cours 16: Modèles spatiaux en EDP
• Cours 17: Types de modèles stochastiques utilisés en épidémiologie (vidéo)
• Cours 18: Modèles en chaînes de Markov (vidéo)
• Cours 19: Simulation des systèmes stochastiques
• Cours 20: Modèles en réseaux
• Cours 21: Modèles agents-centrés
• Cours 22: Ajustement des paramètres
• Cours 23: Publier (vidéo)